迁移 Conda 虚拟环境¶
在一个设备上搭建了 Conda 虚拟环境后，如果需要在另一个设备上使用相同的环境，可以制作 environment.yml 文件，方便快速地迁移，而不需要再次手动安装包。
本文记录了将 macOS 的 Conda 虚拟环境迁移到 Linux 的过程。
制作 environment.yml 文件¶
在 macOS 上输入：
导出的environment.yml文件的内容：
environment.yml
name: py310
channels:
- conda-forge
- bioconda
- defaults
dependencies:
- appnope=0.1.3=pyhd8ed1ab_0
- asttokens=2.4.1=pyhd8ed1ab_0
- bzip2=1.0.8=h93a5062_5
- ca-certificates=2023.11.17=hf0a4a13_0
- comm=0.2.1=pyhd8ed1ab_0
- debugpy=1.8.0=py310h1253130_1
- decorator=5.1.1=pyhd8ed1ab_0
- exceptiongroup=1.2.0=pyhd8ed1ab_2
- executing=2.0.1=pyhd8ed1ab_0
- importlib-metadata=7.0.1=pyha770c72_0
- importlib_metadata=7.0.1=hd8ed1ab_0
- ipykernel=6.29.0=pyh3cd1d5f_0
- ipython=8.20.0=pyh707e725_0
- jedi=0.19.1=pyhd8ed1ab_0
- jupyter_client=8.6.0=pyhd8ed1ab_0
- jupyter_core=5.7.1=py310hbe9552e_0
- libcxx=16.0.6=h4653b0c_0
- libffi=3.4.2=h3422bc3_5
- libsodium=1.0.18=h27ca646_1
- libsqlite=3.44.2=h091b4b1_0
- libzlib=1.2.13=h53f4e23_5
- matplotlib-inline=0.1.6=pyhd8ed1ab_0
- ncurses=6.4=h463b476_2
- nest-asyncio=1.5.9=pyhd8ed1ab_0
- openssl=3.2.0=h0d3ecfb_1
- packaging=23.2=pyhd8ed1ab_0
- parso=0.8.3=pyhd8ed1ab_0
- pexpect=4.8.0=pyh1a96a4e_2
- pickleshare=0.7.5=py_1003
- pip=23.3.2=pyhd8ed1ab_0
- platformdirs=4.1.0=pyhd8ed1ab_0
- prompt-toolkit=3.0.42=pyha770c72_0
- psutil=5.9.8=py310hd125d64_0
- ptyprocess=0.7.0=pyhd3deb0d_0
- pure_eval=0.2.2=pyhd8ed1ab_0
- pygments=2.17.2=pyhd8ed1ab_0
- python=3.10.13=h2469fbe_1_cpython
- python-dateutil=2.8.2=pyhd8ed1ab_0
- python_abi=3.10=4_cp310
- pyzmq=25.1.2=py310hbb13138_0
- readline=8.2=h92ec313_1
- setuptools=69.0.3=pyhd8ed1ab_0
- six=1.16.0=pyh6c4a22f_0
- stack_data=0.6.2=pyhd8ed1ab_0
- tk=8.6.13=h5083fa2_1
- tornado=6.3.3=py310h2aa6e3c_1
- traitlets=5.14.1=pyhd8ed1ab_0
- typing_extensions=4.9.0=pyha770c72_0
- wcwidth=0.2.13=pyhd8ed1ab_0
- wheel=0.42.0=pyhd8ed1ab_0
- xz=5.2.6=h57fd34a_0
- zeromq=4.3.5=h965bd2d_0
- zipp=3.17.0=pyhd8ed1ab_0
- pip:
- annotated-types==0.6.0
- anyio==4.2.0
- cachetools==5.3.2
- certifi==2023.11.17
- charset-normalizer==3.3.2
- click==8.1.7
- colorama==0.4.6
- conda-pack==0.7.1
- contourpy==1.2.0
- cycler==0.12.1
- distro==1.9.0
- fastapi==0.109.0
- fonttools==4.47.2
- h11==0.14.0
- httpcore==1.0.2
- httpx==0.26.0
- idna==3.6
- ipywidgets==8.1.1
- jinja2==3.1.3
- joblib==1.3.2
- jsonpatch==1.33
- jsonpointer==2.4
- jupyterlab-widgets==3.0.9
- kiwisolver==1.4.5
- markdown-it-py==3.0.0
- markupsafe==2.1.4
- marvin==2.1.2
- matplotlib==3.8.2
- mdurl==0.1.2
- numpy==1.26.3
- openai==1.8.0
- pandas==1.5.3
- pillow==10.2.0
- pretty-errors==1.2.25
- pydantic==2.5.3
- pydantic-core==2.14.6
- pydantic-settings==2.1.0
- pyparsing==3.1.1
- python-dotenv==1.0.0
- pytz==2023.3.post1
- regex==2023.12.25
- requests==2.31.0
- rich==13.7.0
- scikit-learn==1.4.0
- scipy==1.11.4
- sniffio==1.3.0
- starlette==0.35.1
- threadpoolctl==3.2.0
- tiktoken==0.5.2
- tqdm==4.66.1
- typer==0.9.0
- tzdata==2023.4
- urllib3==2.1.0
- uvicorn==0.26.0
- widgetsnbextension==4.0.9
prefix: /Users/jeremy/miniconda3/envs/py310
Note
-
我在
channels中手动添加了清华源，希望可以更快速地下载包。 -
我将最后一行
prefix删除了，因为觉得它可能没什么用。
解决 ResolvePackageNotFound 报错¶
如果遇到 ResolvePackageNotFound 报错，可以参考Conda 导入环境时 ResolvePackageNotFound 错误，将“包名称第二个等号及后面的内容”删除。
最终放到 Linux 系统上的 environment.yml 文件为：
environment.yml
name: py310
channels:
- conda-forge
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/pro
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/msys2
- bioconda
- defaults
dependencies:
- appnope=0.1.3
- asttokens=2.4.1
- bzip2=1.0.8
- ca-certificates=2023.11.17
- comm=0.2.1
- debugpy=1.8.0
- decorator=5.1.1
- exceptiongroup=1.2.0
- executing=2.0.1
- importlib-metadata=7.0.1
- importlib_metadata=7.0.1
- ipykernel=6.29.0
- ipython=8.20.0
- jedi=0.19.1
- jupyter_client=8.6.0
- jupyter_core=5.7.1
- libcxx=16.0.6
- libffi=3.4.2
- libsodium=1.0.18
- libsqlite=3.44.2
- libzlib=1.2.13
- matplotlib-inline=0.1.6
- ncurses=6.4
- nest-asyncio=1.5.9
- openssl=3.2.0
- packaging=23.2
- parso=0.8.3
- pexpect=4.8.0
- pickleshare=0.7.5
- pip=23.3.2
- platformdirs=4.1.0
- prompt-toolkit=3.0.42
- psutil=5.9.8
- ptyprocess=0.7.0
- pure_eval=0.2.2
- pygments=2.17.2
- python=3.10.13
- python-dateutil=2.8.2
- python_abi=3.10=4_cp310
- pyzmq=25.1.2
- readline=8.2
- setuptools=69.0.3
- six=1.16.0
- stack_data=0.6.2
- tk=8.6.13
- tornado=6.3.3
- traitlets=5.14.1
- typing_extensions=4.9.0
- wcwidth=0.2.13
- wheel=0.42.0
- xz=5.2.6
- zeromq=4.3.5
- zipp=3.17.0
- pip:
- annotated-types==0.6.0
- anyio==4.2.0
- cachetools==5.3.2
- certifi==2023.11.17
- charset-normalizer==3.3.2
- click==8.1.7
- colorama==0.4.6
- conda-pack==0.7.1
- contourpy==1.2.0
- cycler==0.12.1
- distro==1.9.0
- fastapi==0.109.0
- fonttools==4.47.2
- h11==0.14.0
- httpcore==1.0.2
- httpx==0.26.0
- idna==3.6
- ipywidgets==8.1.1
- jinja2==3.1.3
- joblib==1.3.2
- jsonpatch==1.33
- jsonpointer==2.4
- jupyterlab-widgets==3.0.9
- kiwisolver==1.4.5
- markdown-it-py==3.0.0
- markupsafe==2.1.4
- marvin==2.1.2
- matplotlib==3.8.2
- mdurl==0.1.2
- numpy==1.26.3
- openai==1.8.0
- pandas==1.5.3
- pillow==10.2.0
- pretty-errors==1.2.25
- pydantic==2.5.3
- pydantic-core==2.14.6
- pydantic-settings==2.1.0
- pyparsing==3.1.1
- python-dotenv==1.0.0
- pytz==2023.3.post1
- regex==2023.12.25
- requests==2.31.0
- rich==13.7.0
- scikit-learn==1.4.0
- scipy==1.11.4
- sniffio==1.3.0
- starlette==0.35.1
- threadpoolctl==3.2.0
- tiktoken==0.5.2
- tqdm==4.66.1
- typer==0.9.0
- tzdata==2023.4
- urllib3==2.1.0
- uvicorn==0.26.0
- widgetsnbextension==4.0.9
在 Linux 系统上输入：
等待安装即可。
验证虚拟环境¶
本次迁移虚拟环境是为了使用 Python 3.10 下的 marvin 包，我们可以在新建的 py310 环境中导入它：